Karangkajen Yogyakarta merupakan kampung yang terletak di sebelah selatan Kota Yogyakarta, Daerah Istimewa Yogyakarta. Kampung ini memiliki jejak sejarah yang cukup tinggi, selain merupakan salah satu kampung basis santri di Kota Yogyakarta. Mulai dari keberadaan media Sarekat Islam, yang bernama Bandera Islam, cabang pertama Muhammadiyah, pusat batik Yogyakarta pada masanya, hingga makam beberapa tokoh-tokoh Islam seperti Kyai Haji Ahmad Dahlan, Kyai Haji Abdur Razzaq Fachruddin hingga Prof. Dr. Yunahar Ilyas. Awal mula terbentuknya kampung ini adalah merupakan pekarangan yang diberikan oleh Keraton Yogyakarta kepada para abdi dalem Konco Kaji yang bertugas memimpin upacara keagamaan di Keraton. Beberapa sumber mengungkap bahwa para penduduk kampung ini awalnya adalah para orang-orang keturunan Arab, sebagian mengatakan bahwa mereka adalah keturunan Kyai Nur Iman Mlangi. Memang sejak awalnya kampung ini sangat kental dengan nuansa Islamnya.